Транспортный тупик: сможет ли АПК перейти на цифровые накладные без налоговых потерь?

С 1 сентября 2026 года российский агропромышленный комплекс вступает в фазу обязательного использования электронных перевозочных документов (ЭПД).

Однако масштабная цифровизация логистики рискует обернуться для отрасли серьезными финансовыми потрясениями.

Крупнейшие отраслевые союзы продовольственного сектора обратились к руководству Минтранса и Федеральной налоговой службы (ФНС) с требованием защитить бизнес от фискальных и административных рисков в переходный период.

Штрафы — не главная беда

 
Ранее Минтранс предложил ввести мораторий на жесткие санкции: до 1 марта 2027 года инспекторы ГИБДД и Ространснадзора при отсутствии ЭПД должны ограничиваться устным замечанием, если водитель предъявил бумажный аналог.

Но бизнес считает эту меру недостаточной. Основной удар может прийти не со стороны дорожной полиции, а от налоговых органов.

Поскольку федеральный закон №140 делает электронный формат строго обязательным, оформленные «по старинке» бумажные документы с осени фактически теряют легитимность.

Аграрии обоснованно опасаются, что территориальные налоговые инспекции откажутся признавать такие накладные в качестве подтверждения расходов. Это повлечет за собой массовые доначисления налога на прибыль, отказы в вычетах по НДС и крупные штрафы, которые кратно превысят любые административные штрафы за нарушение правил перевозок.

Позиция ведомств: компромисс с оговорками

 
Реакция профильных министерств оказалась неоднозначной.

Минтранс занял жесткую позицию в отношении инфраструктуры: ведомство отказалось расширять перечень случаев для легального использования бумажных экспедиторских документов, заявив, что это противоречит целям реформы.

Даже мультимодальные перевозки не станут исключением.

Из послаблений — министерство готовит памятку на случай сбоев в ГИС ЭПД и прорабатывает запуск онлайн-информатора о статусе работы системы.

ФНС, в свою очередь, попыталась успокоить рынок. Ведомство разъяснило, что сам по себе бумажный носитель не станет автоматическим поводом для санкций.

Главное условие — налогоплательщик должен доказать объективную невозможность сформировать электронный документ (например, из-за технических сбоев).Налоговики продолжат оценивать реальность сделок по совокупности факторов.

Однако радоваться рано: письмо ФНС носит лишь информационный характер, не является нормативным актом и не гарантирует, что инспекторы на местах не начнут трактовать закон буквально.

Цифровая неготовность

 
Корень проблемы кроется в критически низкой готовности контрагентов.

По данным союза «Союзмолоко», сейчас работать с ГИС ЭПД способны лишь 20–25% логистических партнеров молочных компаний.

В сегменте малого и среднего бизнеса ситуация еще сложнее — в отличие от крупных холдингов, у них нет ресурсов для быстрой отладки ИТ-архитектуры.

Ранее бизнес просил отложить реформу для АПК до 2028 года, ссылаясь на сырость программного обеспечения и отсутствие интеграции с бухгалтерией, но власти выбрали путь форсированного внедрения.

Ближайшие месяцы покажут, станет ли переход на ЭПД драйвером прозрачности или превратится в дополнительный налог на цифровую незрелость рынка. Агробизнесу необходимо срочно форсировать аудит своих перевозчиков, а регуляторам — зафиксировать компромиссные правила игры юридически, а не на словах.